Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Paxbp1P58501 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms