Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf16P58334 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf16P58334 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf16P58334 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf16P58334 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf16P58334 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf16P58334 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf16P58334 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf16P58334 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf16P58334 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf16P58334 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms