Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rce1P57791 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rce1P57791 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rce1P57791 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rce1P57791 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rce1P57791 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rce1P57791 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms