Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ephb3P54754 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ephb3P54754 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb3P54754 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb3P54754 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms