Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CebpaP53566 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CebpaP53566 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CebpaP53566 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CebpaP53566 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CebpaP53566 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CebpaP53566 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CebpaP53566 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CebpaP53566 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CebpaP53566 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CebpaP53566 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CebpaP53566 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CebpaP53566 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CebpaP53566 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CebpaP53566 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CebpaP53566 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms