Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2e1P52482 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2e1P52482 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms