Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ClgnP52194 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ClgnP52194 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ClgnP52194 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClgnP52194 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClgnP52194 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms