Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr4P51680 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr4P51680 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms