Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpdP50404 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpdP50404 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpdP50404 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpdP50404 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpdP50404 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpdP50404 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SftpdP50404 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SftpdP50404 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SftpdP50404 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpdP50404 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms