Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc13P50207 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxc13P50207 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms