Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox5P35710 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox5P35710 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox5P35710 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox5P35710 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox5P35710 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox5P35710 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox5P35710 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox5P35710 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.2 ms