Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp4P35123 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp4P35123 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp4P35123 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp4P35123 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp4P35123 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp4P35123 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp4P35123 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp4P35123 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms