Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms