Protein–RNA interactions for Protein: P31996

Cd68, Macrosialin, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd68P31996 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd68P31996 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd68P31996 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd68P31996 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd68P31996 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd68P31996 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd68P31996 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd68P31996 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd68P31996 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd68P31996 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd68P31996 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd68P31996 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd68P31996 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd68P31996 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd68P31996 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd68P31996 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd68P31996 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd68P31996 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd68P31996 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd68P31996 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms