Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Etv4P28322 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Etv4P28322 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Etv4P28322 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Etv4P28322 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms