Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LoxP28301 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LoxP28301 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LoxP28301 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LoxP28301 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LoxP28301 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LoxP28301 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LoxP28301 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LoxP28301 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LoxP28301 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LoxP28301 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LoxP28301 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LoxP28301 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LoxP28301 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LoxP28301 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LoxP28301 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LoxP28301 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LoxP28301 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LoxP28301 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LoxP28301 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LoxP28301 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LoxP28301 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LoxP28301 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LoxP28301 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LoxP28301 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LoxP28301 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LoxP28301 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LoxP28301 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LoxP28301 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LoxP28301 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LoxP28301 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LoxP28301 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LoxP28301 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LoxP28301 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LoxP28301 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LoxP28301 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LoxP28301 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LoxP28301 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LoxP28301 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LoxP28301 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LoxP28301 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LoxP28301 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LoxP28301 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LoxP28301 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LoxP28301 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LoxP28301 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LoxP28301 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LoxP28301 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LoxP28301 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LoxP28301 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LoxP28301 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LoxP28301 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LoxP28301 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LoxP28301 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LoxP28301 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LoxP28301 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LoxP28301 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LoxP28301 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms