Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb1P28230 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gjb1P28230 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gjb1P28230 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms