Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Ggta1P23336 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Ggta1P23336 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Ggta1P23336 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Ggta1P23336 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Ggta1P23336 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Ggta1P23336 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ggta1P23336 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ggta1P23336 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms