Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkchP23298 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkchP23298 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkchP23298 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkchP23298 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkchP23298 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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