Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gadd45bP22339 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gadd45bP22339 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms