Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tap1P21958 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tap1P21958 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tap1P21958 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tap1P21958 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tap1P21958 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tap1P21958 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tap1P21958 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tap1P21958 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tap1P21958 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tap1P21958 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tap1P21958 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms