Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klra1P20937 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klra1P20937 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klra1P20937 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klra1P20937 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klra1P20937 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Klra1P20937 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klra1P20937 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klra1P20937 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klra1P20937 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms