Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcaP20444 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms