Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntf3P20181 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms