Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csn1s1P19228 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms