Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc6P10629 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc6P10629 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms