Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP10400 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP10400 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP10400 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP10400 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP10400 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP10400 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP10400 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP10400 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP10400 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP10400 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP10400 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP10400 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP10400 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP10400 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP10400 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP10400 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP10400 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP10400 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP10400 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP10400 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms