Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UbbP0CG49 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms