Protein–RNA interactions for Protein: P09542

Myl3, Myosin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl3P09542 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl3P09542 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myl3P09542 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl3P09542 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl3P09542 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myl3P09542 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myl3P09542 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myl3P09542 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl3P09542 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl3P09542 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myl3P09542 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myl3P09542 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl3P09542 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl3P09542 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl3P09542 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myl3P09542 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms