Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P04212 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P04212 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04212 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04212 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04212 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04212 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04212 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04212 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P04212 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04212 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04212 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P04212 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04212 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04212 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04212 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04212 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04212 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P04212 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04212 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P04212 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
P04212 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P04212 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P04212 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P04212 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04212 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04212 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04212 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04212 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04212 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04212 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04212 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04212 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P04212 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P04212 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04212 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04212 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P04212 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04212 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04212 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04212 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04212 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04212 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04212 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04212 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04212 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04212 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04212 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04212 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04212 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04212 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04212 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04212 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04212 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P04212 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04212 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04212 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04212 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04212 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04212 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04212 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04212 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04212 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04212 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04212 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms