Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tk1P04184 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tk1P04184 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tk1P04184 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tk1P04184 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tk1P04184 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tk1P04184 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tk1P04184 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tk1P04184 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tk1P04184 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tk1P04184 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tk1P04184 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tk1P04184 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tk1P04184 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms