Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a1P02463 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a1P02463 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a1P02463 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a1P02463 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms