Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
P01734 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
P01734 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01734 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
P01734 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01734 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01734 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01734 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01734 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01734 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01734 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01734 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01734 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01734 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01734 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
P01734 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01734 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01734 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01734 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01734 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
P01734 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01734 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01734 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01734 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01734 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01734 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01734 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01734 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01734 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01734 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01734 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01734 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01734 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01734 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01734 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01734 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01734 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01734 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01734 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01734 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01734 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01734 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01734 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
P01734 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01734 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01734 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01734 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01734 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01734 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01734 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
P01734 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01734 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01734 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01734 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01734 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01734 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01734 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01734 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01734 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01734 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01734 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01734 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01734 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01734 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01734 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01734 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01734 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01734 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01734 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01734 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01734 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01734 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01734 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01734 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01734 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01734 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01734 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01734 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
P01734 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01734 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01734 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01734 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01734 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01734 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01734 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01734 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01734 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01734 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms