Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifnb1P01575 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnb1P01575 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms