Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfrO88507 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CntfrO88507 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CntfrO88507 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntfrO88507 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntfrO88507 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntfrO88507 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntfrO88507 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntfrO88507 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntfrO88507 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms