Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IGSF3O75054 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms