Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nptx2O70340 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nptx2O70340 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms