Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3O55013 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3O55013 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3O55013 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3O55013 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms