Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf12O54907 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf12O54907 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms