Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxO54751 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxO54751 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxO54751 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxO54751 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxO54751 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxO54751 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxO54751 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxO54751 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxO54751 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxO54751 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxO54751 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxO54751 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxO54751 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxO54751 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxO54751 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxO54751 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxO54751 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxO54751 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxO54751 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CrxO54751 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CrxO54751 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CrxO54751 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CrxO54751 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CrxO54751 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CrxO54751 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CrxO54751 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CrxO54751 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxO54751 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms