Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnd2O35927 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnd2O35927 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms