Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpibO35906 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpibO35906 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpibO35906 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpibO35906 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SpibO35906 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SpibO35906 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SpibO35906 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SpibO35906 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SpibO35906 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SpibO35906 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SpibO35906 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpibO35906 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpibO35906 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpibO35906 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpibO35906 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpibO35906 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpibO35906 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpibO35906 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpibO35906 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpibO35906 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpibO35906 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpibO35906 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpibO35906 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpibO35906 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpibO35906 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpibO35906 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpibO35906 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpibO35906 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpibO35906 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpibO35906 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpibO35906 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpibO35906 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpibO35906 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpibO35906 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpibO35906 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpibO35906 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpibO35906 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SpibO35906 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpibO35906 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpibO35906 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SpibO35906 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpibO35906 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpibO35906 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpibO35906 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpibO35906 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SpibO35906 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpibO35906 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpibO35906 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpibO35906 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpibO35906 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpibO35906 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpibO35906 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpibO35906 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpibO35906 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpibO35906 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpibO35906 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpibO35906 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpibO35906 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpibO35906 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpibO35906 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpibO35906 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpibO35906 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpibO35906 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpibO35906 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpibO35906 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpibO35906 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpibO35906 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpibO35906 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpibO35906 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpibO35906 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpibO35906 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpibO35906 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpibO35906 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpibO35906 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpibO35906 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpibO35906 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpibO35906 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpibO35906 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpibO35906 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpibO35906 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpibO35906 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpibO35906 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpibO35906 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpibO35906 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpibO35906 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SpibO35906 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SpibO35906 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SpibO35906 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SpibO35906 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SpibO35906 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpibO35906 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpibO35906 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SpibO35906 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpibO35906 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpibO35906 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpibO35906 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms