Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppfibp2O35711 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp2O35711 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfibp2O35711 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms