Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag2O35638 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag2O35638 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag2O35638 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag2O35638 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag2O35638 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stag2O35638 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag2O35638 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag2O35638 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag2O35638 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag2O35638 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stag2O35638 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag2O35638 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag2O35638 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag2O35638 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag2O35638 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms