Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Dgcr6O35347 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dgcr6O35347 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dgcr6O35347 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms