Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Kpna3O35344 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna3O35344 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna3O35344 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms