Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Dctn1O08788 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dctn1O08788 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Dctn1O08788 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms