Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltaO08585 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltaO08585 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltaO08585 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltaO08585 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CltaO08585 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CltaO08585 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CltaO08585 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CltaO08585 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CltaO08585 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CltaO08585 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CltaO08585 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CltaO08585 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CltaO08585 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CltaO08585 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CltaO08585 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CltaO08585 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CltaO08585 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CltaO08585 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CltaO08585 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CltaO08585 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CltaO08585 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CltaO08585 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CltaO08585 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CltaO08585 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CltaO08585 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CltaO08585 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CltaO08585 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CltaO08585 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CltaO08585 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CltaO08585 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CltaO08585 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CltaO08585 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CltaO08585 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CltaO08585 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CltaO08585 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CltaO08585 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CltaO08585 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CltaO08585 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CltaO08585 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CltaO08585 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CltaO08585 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CltaO08585 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CltaO08585 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CltaO08585 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CltaO08585 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CltaO08585 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CltaO08585 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CltaO08585 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CltaO08585 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CltaO08585 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CltaO08585 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CltaO08585 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CltaO08585 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CltaO08585 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CltaO08585 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CltaO08585 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CltaO08585 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CltaO08585 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CltaO08585 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CltaO08585 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CltaO08585 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CltaO08585 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CltaO08585 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CltaO08585 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CltaO08585 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CltaO08585 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CltaO08585 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CltaO08585 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CltaO08585 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CltaO08585 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CltaO08585 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CltaO08585 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CltaO08585 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltaO08585 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltaO08585 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltaO08585 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltaO08585 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltaO08585 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltaO08585 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltaO08585 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltaO08585 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltaO08585 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltaO08585 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltaO08585 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltaO08585 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltaO08585 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltaO08585 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltaO08585 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltaO08585 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.3 ms