Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna5O08543 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna5O08543 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna5O08543 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna5O08543 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna5O08543 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna5O08543 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna5O08543 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Efna5O08543 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efna5O08543 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms