Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms